个人账户收款、买单出口、企业长期零申报、工资个税、隐匿收入等，这些是跨境电商企业日常最常见的财税风险，也是很多卖家老板最为关心要如何解决的。其实，跨境电商企业还有一个风险是最容易被忽视的，那就是物流发票。特别是现在金税四期时代，税务局机关通过大数据分析，很容易就可以查到物流发票的风险点，从而让企业自查。

2024年，我们收到很多跨境电商企业的反馈，说是税务系统直接发来税务机关的风险提示函。提示函显示，根据系统疑点筛查，他们公司并非出口企业，无跨境业务，但是却取得了物流公司开具的跨境运输免税的发票，要求该企业对这部分数据进行自查，对业务情况做如下解释并提供对应的单证资料：

1.该业务是否真实进行交易？

2.委托方和付款方的发票是否一致？

3.出口货物交易的相关单证齐全吗？

其实如果大家关注过“财税合规”内容，那么就会明白这三点是日常交易时，必须要着重注意的事情。也就是说衡量一项业务是否真实，需要业务流、票据流、资金流、货物流四流合一，形成闭环，否则就会出现税务风险。

物流发票风险产生的根源是什么？

大多数做跨境电商或做外贸的公司都会在物流商那里开通物流账户，该等账户的开具主体一般都是国内的公司。

并且这些账户往往年限比较长，能享受物流商的折扣也比较大。

但开立这些物流账户的公司不是公司的运营主体，只是一个店铺公司，没有人员，没有收入，对应的物流费由其他公司代付。

但物流商收到相关费用后，默认该费用就是开立物流账户的公司发生的，并给物流账户公司开具了发票（一般为增值税普通发票，不涉及进项抵扣），且相关发票并未交付给物流账户公司，所以公司并不知道有这种业务发生，当税务局稽核物流公司发票时，查到相关发票都是同一客户的，且累计金额很大，所以便发生了上述场景。

举个例子，比如您是跨境电商卖家，店铺是境外注册的公司，用境外公司抬头做电商销售，但是通过国内的公司采购和运营。由于国内公司未合规报关，而是直接买单出口，物流公司又直接将免税物流发票开给了国内公司，但是国内公司在纳税申报的时候，免税收入又是零申报，于是就出现了风险点。

物流发票问题该如何解决？

很多跨境电商企业都存在着物流发票的风险情况，如果有收到风险警告，那一定要及时进行自查。

1.提交对应的申报表给税务机关时，是不是已经把你的境外收入纳入进来之后再进行的申报，还是说一直以来都做的零申报；

2.物流公司开具的发票抬头能否换成境外公司的，还是说对应物流公司在做这个案子的时候，只能用你的国内公司进行注册，因为很多物流商要求只能给国内的公司开票。

当发现问题后，首先要弄清楚业务流，查清收入源头在哪里，接下来就要从架构去做规范，规范架构之后，最重要的是税务：做合规首先一定要将收入确认主体。如果你连收入主体都没有，那你这个费用支出和货物的成本放在这个主体公司，根据企业会计的要求，收入和成本就不匹配，其实这就违背了匹配原则，这个事情能引发出来很多其他问题。这个案件的核心问题在于，国内企业并未就跨境电商出口业务做收入确认，却将对应货物的物流成本做了费用列支。当税务机关查处的时候，企业很难就该业务实质做清楚说明，从而牵扯出更多的问题。

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